rx mol.rx mol.out1 mol.out2
Склеивает две выдачи IRC в один путь реакции (mol.out1
и mol.out2
получены с back=1
и back=0
).
rrx mol.rx mol.rrx
Разворачивает полученную склейку задом наперёд.
debutfin mol.rx
Создаёт файлы mol.rx.1.in
и mol.rx.2.in
с первой и последней структурами из склейки и шапкой из mol.in
.
en mol1.in mol2.in <...> molN.in
Выводит список файлов по маске mol1~mol2~<...>~mol3_*.in
и энергии относительно E(mol1)+E(mol2)+…+E(molN) в ккал/моль.
Если имя файла содержит x
или y
(переходное состояние), и а) в нём нет вторых производных, энергия печатается розовыми буквами,
б) нет соответствующего файла .rx
— синими.
Если запущен процесс с именем файла в аргументах, энергия печатается на красном фоне.
ensort mol suf
Переименовывает файлы mol_<номер>.suf.in
по возрастанию энергии.
sm mol.out
Вставляет в mol.in
структуру с максимальной энергией (mol.out
получена с task=scan
).
gs mol.out N
Создаёт файл mol.scanN.in
с шапкой из mol.in
и N-ой точкой скана из mol.out
(нумерация с 0)
lm mol.out
Вставляет в mol.in
последнюю структуру из mol.out
, если оптимизация не сошлась.
gnmr mol.out
gesr mol.out
Sun Mar 5 21:43:31 MSK 2017